More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3169 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Replicon accession
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Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3169  putative transport, fragment transmembrane protein  100 
 
 		 126 aa  250  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6252  sodium:dicarboxylate symporter  65.26 
 
 		 442 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  normal  0.842573 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6468  sodium:dicarboxylate symporter  61.22 
 
 		 442 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.955844  normal  0.0248013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5604  sodium:dicarboxylate symporter  61.22 
 
 		 442 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5968  sodium:dicarboxylate symporter  61.22 
 
 		 442 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431964  hitchhiker  0.00472549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  62.07 
 
 		 443 aa  106  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  63.86 
 
 		 438 aa  104  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  61.45 
 
 		 443 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  63.86 
 
 		 438 aa  104  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  63.86 
 
 		 438 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  62.65 
 
 		 442 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  62.65 
 
 		 442 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  62.65 
 
 		 442 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  62.65 
 
 		 442 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  63.75 
 
 		 444 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  60.24 
 
 		 438 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  63.75 
 
 		 444 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  61.45 
 
 		 443 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  61.45 
 
 		 443 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  60.24 
 
 		 438 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  60.24 
 
 		 438 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  56.63 
 
 		 436 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  56.63 
 
 		 436 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  56.63 
 
 		 436 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  56.63 
 
 		 436 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  56.63 
 
 		 436 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  53.01 
 
 		 437 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  53.01 
 
 		 437 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  53.01 
 
 		 437 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  53.01 
 
 		 437 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  53.01 
 
 		 437 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  53.01 
 
 		 437 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  53.01 
 
 		 437 aa  90.9  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  53.01 
 
 		 437 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  53.01 
 
 		 437 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2242  Sodium:dicarboxylate symporter  55 
 
 		 419 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  57.83 
 
 		 438 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  55 
 
 		 422 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0277  glutamate/aspartate:proton symporter  56.63 
 
 		 437 aa  82  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2416  sodium:dicarboxylate symporter  48.1 
 
 		 438 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  48.28 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1524  proton/glutamate symporter family protein  61.25 
 
 		 423 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.0675800000000005e-55 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1450  proton/glutamate symporter family protein  61.25 
 
 		 423 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000273308  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2071  sodium:dicarboxylate symporter  59.15 
 
 		 431 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.840626  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1315  proton/sodium-glutamate symport protein  61.25 
 
 		 423 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.63752e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1487  proton/glutamate symporter family protein  61.25 
 
 		 424 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1340  proton/glutamate symporter protein, N-terminus  61.25 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000478682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  61.25 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1314  proton/sodium-glutamate symport protein  61.25 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000288738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3857  proton/glutamate symporter family protein  61.25 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000638682  decreased coverage  0.00000000000134337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  61.25 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  50 
 
 		 423 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  51.25 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  50 
 
 		 423 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  51.25 
 
 		 423 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  51.25 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  50 
 
 		 423 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  50 
 
 		 423 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  51.25 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  50 
 
 		 423 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1771  sodium:dicarboxylate symporter  47.5 
 
 		 437 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.975695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1355  sodium:dicarboxylate symporter  60 
 
 		 424 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000159183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1153  sodium:dicarboxylate symporter  58.75 
 
 		 423 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000424647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0756  proton/sodium-glutamate symporter  56.25 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0642378  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  72.92 
 
 		 746 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  46.15 
 
 		 411 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  46.15 
 
 		 411 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  46.15 
 
 		 411 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  46.15 
 
 		 411 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  46.15 
 
 		 411 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  45.05 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 411 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 413 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  46.15 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  43.96 
 
 		 411 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  43.96 
 
 		 411 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  43.96 
 
 		 411 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  43.96 
 
 		 411 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2469  sodium:dicarboxylate symporter  53.62 
 
 		 421 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3423  sodium:dicarboxylate symporter  40.66 
 
 		 495 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  40.23 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  37.36 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00954  hypothetical protein  85.29 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.32884  normal  0.497692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1265  sodium:dicarboxylate symporter  37.5 
 
 		 433 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.623713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3410  sodium:dicarboxylate symporter  39.56 
 
 		 502 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2653  sodium:dicarboxylate symporter  41.03 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.620736  normal  0.627306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  40.45 
 
 		 425 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6387  sodium:dicarboxylate symporter  45.21 
 
 		 456 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  33.04 
 
 		 443 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0997  Sodium/dicarboxylate symporter  37.04 
 
 		 458 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  40.26 
 
 		 432 aa  60.5  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A3356  Sodium/dicarboxylate symporter  46.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60762  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_5393  sodium:dicarboxylate symporter  46.58 
 
 		 455 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4705  sodium:dicarboxylate symporter  41.03 
 
 		 419 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.600278 
 
 
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NC_002976  SERP1976  proton/sodium-glutamate symport protein  37.97 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.809578  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  36.26 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_0008  sodium:dicarboxylate symporter  44.16 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_1270  sodium:dicarboxylate symporter  44.93 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.792848 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3554  sodium:dicarboxylate symporter  46.58 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325233 
 
 
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NC_008391  Bamb_4136  sodium:dicarboxylate symporter  34.57 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
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