56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2789 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  927    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  64.43 
 
 		 486 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  65.37 
 
 		 372 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  54.25 
 
 		 591 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  36.36 
 
 		 357 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  70.83 
 
 		 561 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1492  zinc finger/thioredoxin putative  40.98 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  33.92 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  32.39 
 
 		 575 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  32.39 
 
 		 375 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  33.9 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3429  MJ0042 family finger-like protein  34.53 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219707  normal  0.0286835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1102  Zinc finger/thioredoxin putative  27.13 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0261742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  30.43 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3389  Zinc finger-domain-containing protein  34.07 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363159  normal  0.721643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  23.24 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  31.82 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  33.09 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3350  Zinc finger/thioredoxin putative  36.3 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0952  MJ0042 family finger-like protein  62.79 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  34.92 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0860  Zinc finger-domain-containing protein  64.1 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237277  normal  0.0721112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  65.79 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  65.79 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  32.02 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2750  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  36 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1497  Zinc finger-domain-containing protein  50.88 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  36 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  36.19 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  33.07 
 
 		 388 aa  57  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  52.38 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  52.38 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  54.76 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  54.76 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  54.76 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  54.76 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  54.76 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  54.76 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  54.76 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  39.24 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.91 
 
 		 2449 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 		 452 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  41.67 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  44.19 
 
 		 455 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  44.19 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  44.19 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  42.62 
 
 		 453 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  44.19 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  40.35 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0977  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.489374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  48.72 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  38.21 
 
 		 2397 aa  44.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  31.87 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>