58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0809 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  835    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  30.65 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  33.94 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  34.32 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  30.84 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  45.24 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  46.15 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  45.56 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  43.45 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  45.56 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  51.11 
 
 		 425 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  50 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  39.04 
 
 		 452 aa  109  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  34.59 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0609  hypothetical protein  29.58 
 
 		 163 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115481  hitchhiker  0.0000000161678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1048  hypothetical protein  30.92 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  52.08 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02997  hypothetical protein  26.02 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  28.08 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3653  hypothetical protein  28.7 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2750  hypothetical protein  51.06 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  46 
 
 		 471 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  46 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  46 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  48.78 
 
 		 591 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  46 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  46 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  48.78 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  46 
 
 		 460 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3389  Zinc finger-domain-containing protein  37.88 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363159  normal  0.721643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1497  Zinc finger-domain-containing protein  41.82 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  44.07 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0860  Zinc finger-domain-containing protein  45.45 
 
 		 532 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237277  normal  0.0721112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  21.99 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  46.51 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  46.51 
 
 		 445 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  40.98 
 
 		 357 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  41.25 
 
 		 479 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  25.94 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3350  Zinc finger/thioredoxin putative  43.4 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1102  Zinc finger/thioredoxin putative  36.07 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0261742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0977  hypothetical protein  24.03 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.489374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  25 
 
 		 473 aa  50.4  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  28.97 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  43.59 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0952  MJ0042 family finger-like protein  42.5 
 
 		 447 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  45 
 
 		 575 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  45 
 
 		 475 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  45 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3429  MJ0042 family finger-like protein  45 
 
 		 466 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219707  normal  0.0286835 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  45 
 
 		 475 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  45 
 
 		 475 aa  46.6  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  45 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  45 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  45 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  45 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  45 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  24.16 
 
 		 372 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>