57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1497 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1497  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 		 475 aa  922    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  47.43 
 
 		 445 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1492  zinc finger/thioredoxin putative  49.43 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  32.58 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3389  Zinc finger-domain-containing protein  40.84 
 
 		 329 aa  111  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363159  normal  0.721643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  34.88 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1102  Zinc finger/thioredoxin putative  37.5 
 
 		 363 aa  99.8  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0261742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0952  MJ0042 family finger-like protein  37.42 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3350  Zinc finger/thioredoxin putative  36.21 
 
 		 313 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0860  Zinc finger-domain-containing protein  78 
 
 		 532 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237277  normal  0.0721112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  38.46 
 
 		 591 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  77.27 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  33.85 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  30.06 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  28.89 
 
 		 575 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  31.41 
 
 		 561 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  34.86 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  27.94 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.74 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.74 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  28.89 
 
 		 475 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.74 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.74 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  27.74 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  28.89 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  28.89 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3429  MJ0042 family finger-like protein  28.15 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219707  normal  0.0286835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  27.41 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  48.61 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.1 
 
 		 2449 aa  64.3  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  28.15 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  27.41 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  27.41 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  59.09 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  26.67 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  58.54 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  25.93 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  25.19 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  31.11 
 
 		 359 aa  54.3  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  51.35 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  25.21 
 
 		 2914 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  47.5 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  44.64 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  45 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2002  Zinc finger-domain-containing protein  40.28 
 
 		 319 aa  51.2  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  52.38 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  50 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  42.19 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1048  hypothetical protein  29.81 
 
 		 229 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101153  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  43.64 
 
 		 280 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  50 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2750  hypothetical protein  41.86 
 
 		 293 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  41.58 
 
 		 762 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>