39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1492 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1492  zinc finger/thioredoxin putative  100 
 
 		 321 aa  617  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  51.98 
 
 		 445 aa  178  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  51.49 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0860  Zinc finger-domain-containing protein  61.4 
 
 		 532 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237277  normal  0.0721112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3350  Zinc finger/thioredoxin putative  37.85 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1497  Zinc finger-domain-containing protein  50.59 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1102  Zinc finger/thioredoxin putative  32.8 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0261742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3389  Zinc finger-domain-containing protein  32.35 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363159  normal  0.721643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0952  MJ0042 family finger-like protein  44.79 
 
 		 447 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  38.64 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  38.99 
 
 		 372 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  38.99 
 
 		 486 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  33.14 
 
 		 441 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  36.88 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  37.65 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  39.84 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  25.86 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  34.38 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  25.43 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  32.77 
 
 		 479 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  31.93 
 
 		 466 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  31.93 
 
 		 466 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3429  MJ0042 family finger-like protein  30.08 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219707  normal  0.0286835 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  31.09 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  31.11 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  31.36 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  31.09 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  31.09 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  31.09 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  34.65 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  30.83 
 
 		 446 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 475 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 475 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 		 475 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  28.57 
 
 		 475 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  28.57 
 
 		 475 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  30 
 
 		 475 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  28.64 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>