58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3468 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  98.74 
 
 
475 aa  919    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  98.74 
 
 
475 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  98.74 
 
 
475 aa  919    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  98.95 
 
 
475 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  99.58 
 
 
475 aa  928    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
475 aa  933    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  98.74 
 
 
475 aa  919    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  78.83 
 
 
446 aa  626  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  71.13 
 
 
460 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  57.74 
 
 
456 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  72.83 
 
 
466 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  72.83 
 
 
466 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  70.77 
 
 
471 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  68.69 
 
 
467 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  70.43 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  52.19 
 
 
575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3429  MJ0042 family finger-like protein  56.08 
 
 
466 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219707  normal  0.0286835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  56.68 
 
 
434 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  35.25 
 
 
332 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  38.56 
 
 
591 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  35.44 
 
 
398 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  35.67 
 
 
372 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  37.59 
 
 
561 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  29.34 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  32.89 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1497  Zinc finger-domain-containing protein  29.49 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  29.14 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  53.06 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  53.06 
 
 
445 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  54.76 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  54.76 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  46.27 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  54.76 
 
 
451 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1102  Zinc finger/thioredoxin putative  53.19 
 
 
363 aa  60.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0261742  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3350  Zinc finger/thioredoxin putative  41.89 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0952  MJ0042 family finger-like protein  58.97 
 
 
447 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  46.55 
 
 
422 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  54.76 
 
 
440 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 
441 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  42.42 
 
 
421 aa  57.4  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  54.76 
 
 
486 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0860  Zinc finger-domain-containing protein  48.89 
 
 
532 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237277  normal  0.0721112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  46.94 
 
 
280 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  25.33 
 
 
404 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2750  hypothetical protein  46.81 
 
 
293 aa  53.9  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  54.76 
 
 
473 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3389  Zinc finger-domain-containing protein  26.34 
 
 
329 aa  53.9  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363159  normal  0.721643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1492  zinc finger/thioredoxin putative  28.26 
 
 
321 aa  53.5  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  54.76 
 
 
388 aa  53.5  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1649  Zinc finger/thioredoxin putative  40.91 
 
 
420 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471383  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  53.66 
 
 
424 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  45.83 
 
 
425 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  47.62 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1048  hypothetical protein  26.57 
 
 
229 aa  46.6  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101153  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2002  Zinc finger-domain-containing protein  44.62 
 
 
319 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1855  MJ0042 family finger-like protein  41.38 
 
 
383 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  26.02 
 
 
455 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>