31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1649 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1649  Zinc finger/thioredoxin putative  100 
 
 
420 aa  860    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471383  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  18.45 
 
 
421 aa  53.9  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  20.92 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
475 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  27.5 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  27.5 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  40.48 
 
 
467 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  29.17 
 
 
575 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  40.48 
 
 
471 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  38.1 
 
 
479 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  42.86 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  38.1 
 
 
446 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  35.71 
 
 
456 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  35.71 
 
 
460 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  41.3 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  41.3 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  36.84 
 
 
453 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  35.71 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  35.71 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  41.3 
 
 
451 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  35.71 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  21.16 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0977  hypothetical protein  26.56 
 
 
225 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.489374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  26.17 
 
 
440 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2002  Zinc finger-domain-containing protein  45.71 
 
 
319 aa  43.9  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  39.13 
 
 
388 aa  43.1  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  39.13 
 
 
422 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>