59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0571 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 
460 aa  913    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  95.28 
 
 
466 aa  796    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  95.28 
 
 
466 aa  796    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  80.9 
 
 
456 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  74.47 
 
 
471 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  73.42 
 
 
467 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  60.16 
 
 
479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  50 
 
 
446 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  48.49 
 
 
475 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  48.49 
 
 
475 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  48.49 
 
 
475 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  48.49 
 
 
475 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  74.01 
 
 
475 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  74.01 
 
 
475 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  74.01 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  41.04 
 
 
575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  58.92 
 
 
434 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  30.8 
 
 
332 aa  95.9  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  36.94 
 
 
591 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  36.17 
 
 
561 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  23.47 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3429  MJ0042 family finger-like protein  36.55 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219707  normal  0.0286835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  29.61 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  31.85 
 
 
372 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1497  Zinc finger-domain-containing protein  27.85 
 
 
475 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  34.23 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  48.44 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1102  Zinc finger/thioredoxin putative  38.4 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0261742  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  30.43 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  57.14 
 
 
442 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  57.14 
 
 
455 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  50.94 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  55.81 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  52.17 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  54.76 
 
 
451 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  41.46 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  54.76 
 
 
451 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1492  zinc finger/thioredoxin putative  31.09 
 
 
321 aa  60.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  52.17 
 
 
453 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3350  Zinc finger/thioredoxin putative  41.43 
 
 
313 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0860  Zinc finger-domain-containing protein  30.83 
 
 
532 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237277  normal  0.0721112 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  52.38 
 
 
486 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  57.14 
 
 
388 aa  57.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  52.5 
 
 
452 aa  56.6  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  60 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  52.38 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2750  hypothetical protein  52.27 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3389  Zinc finger-domain-containing protein  24.14 
 
 
329 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363159  normal  0.721643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  51.22 
 
 
280 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  47.62 
 
 
404 aa  53.5  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.9 
 
 
2449 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  50 
 
 
421 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  50 
 
 
425 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0952  MJ0042 family finger-like protein  31.31 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0609  hypothetical protein  33.57 
 
 
163 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115481  hitchhiker  0.0000000161678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  25.79 
 
 
440 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1649  Zinc finger/thioredoxin putative  35.71 
 
 
420 aa  46.6  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.471383  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  36.11 
 
 
417 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2002  Zinc finger-domain-containing protein  29.35 
 
 
319 aa  44.3  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>