31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0609 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0609  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  326  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115481  hitchhiker  0.0000000161678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  29.73 
 
 
388 aa  77.8  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  31.01 
 
 
424 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  31.65 
 
 
421 aa  74.7  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  28.68 
 
 
453 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  29.46 
 
 
422 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1048  hypothetical protein  33.77 
 
 
229 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  29.58 
 
 
404 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3653  hypothetical protein  31.93 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  27.52 
 
 
440 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2002  Zinc finger-domain-containing protein  31.88 
 
 
319 aa  67.4  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  27.91 
 
 
425 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  30.08 
 
 
452 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  31.11 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  27.91 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  28.68 
 
 
455 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  28.68 
 
 
451 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0977  hypothetical protein  29.25 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.489374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  27.94 
 
 
451 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  27.94 
 
 
442 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02997  hypothetical protein  27.91 
 
 
356 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  30.52 
 
 
398 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  32.73 
 
 
332 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  35.53 
 
 
359 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  35 
 
 
591 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  33.98 
 
 
561 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  32.62 
 
 
372 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  32.62 
 
 
486 aa  43.9  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  31.3 
 
 
375 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0372  MJ0042 family finger-like protein  38.18 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.14775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0193  MJ0042 family finger-like domain protein  38.18 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>