34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02997 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02997  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0977  hypothetical protein  56.46 
 
 		 225 aa  186  8e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.489374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3653  hypothetical protein  62.18 
 
 		 199 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  33.11 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0609  hypothetical protein  30.07 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115481  hitchhiker  0.0000000161678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  29.93 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  28.19 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  27.41 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  27.81 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  27.74 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  27.01 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  27.01 
 
 		 455 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  27.01 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  28.89 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  28.89 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  26.28 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1048  hypothetical protein  25.33 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  28.95 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  35.09 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  26.9 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  30.22 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  20.67 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  32 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2002  Zinc finger-domain-containing protein  28.57 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  31.19 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  31.61 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  27.17 
 
 		 486 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  27.17 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  37.25 
 
 		 441 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  30.73 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  29.63 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  30.23 
 
 		 446 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  28.57 
 
 		 479 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>