28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3653 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3653  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  393  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800289 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0977  hypothetical protein  55 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.489374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02997  hypothetical protein  60.4 
 
 		 356 aa  167  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0609  hypothetical protein  32.88 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115481  hitchhiker  0.0000000161678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  32.59 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1048  hypothetical protein  28.17 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  30.82 
 
 		 440 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  30.71 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  30.95 
 
 		 422 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  29.37 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  28.29 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  28.15 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 421 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  28.28 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  26.44 
 
 		 451 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  29.41 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  24.83 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  26.44 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  27.67 
 
 		 455 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  26.35 
 
 		 591 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  29.25 
 
 		 421 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  35.2 
 
 		 445 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2002  Zinc finger-domain-containing protein  27.42 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  35.2 
 
 		 445 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  31.13 
 
 		 398 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  28.11 
 
 		 561 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  29.45 
 
 		 357 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  27 
 
 		 332 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>