60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3447 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  100 
 
 
421 aa  855    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  32.83 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  33.12 
 
 
455 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  32.61 
 
 
451 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  32.74 
 
 
440 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  34.85 
 
 
425 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  35.32 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  29.43 
 
 
404 aa  170  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  29.3 
 
 
452 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  43.93 
 
 
442 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  43.14 
 
 
388 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  35.6 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  45.99 
 
 
422 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0609  hypothetical protein  31.65 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115481  hitchhiker  0.0000000161678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  25.48 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  46.67 
 
 
453 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02997  hypothetical protein  27.34 
 
 
356 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1048  hypothetical protein  26.53 
 
 
229 aa  61.6  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  28.63 
 
 
460 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  57.14 
 
 
466 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  57.14 
 
 
466 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  42.25 
 
 
479 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1102  Zinc finger/thioredoxin putative  30.54 
 
 
363 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0261742  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  57.14 
 
 
456 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  54.76 
 
 
471 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  54.76 
 
 
467 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  47.27 
 
 
441 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  52.38 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2002  Zinc finger-domain-containing protein  25.95 
 
 
319 aa  57  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.144373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  25.48 
 
 
591 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  50 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  50 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  56.76 
 
 
575 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3429  MJ0042 family finger-like protein  56.76 
 
 
466 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219707  normal  0.0286835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  44.68 
 
 
561 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3350  Zinc finger/thioredoxin putative  39.06 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  56.76 
 
 
434 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  50 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  50 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  50 
 
 
475 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  50 
 
 
446 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3653  hypothetical protein  29.41 
 
 
199 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800289 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  54.05 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  44.44 
 
 
486 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1497  Zinc finger-domain-containing protein  51.35 
 
 
475 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  26.99 
 
 
372 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  30.33 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2750  hypothetical protein  54.05 
 
 
293 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0952  MJ0042 family finger-like protein  48.72 
 
 
447 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0860  Zinc finger-domain-containing protein  48.57 
 
 
532 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237277  normal  0.0721112 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2546  hypothetical protein  51.43 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.73982e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  42.86 
 
 
473 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3389  Zinc finger-domain-containing protein  29.14 
 
 
329 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363159  normal  0.721643 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  28.1 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0977  hypothetical protein  23.49 
 
 
225 aa  46.6  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.489374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>