54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2750 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2750  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  29.96 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3936  hypothetical protein  26.55 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00733105  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  26.78 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  52.17 
 
 
398 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  50 
 
 
486 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  48.89 
 
 
473 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2782  Zinc finger-domain-containing protein  54.55 
 
 
479 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3350  Zinc finger/thioredoxin putative  50 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.412655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  52.38 
 
 
404 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0504  Zinc finger-domain-containing protein  52.27 
 
 
471 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0571  Zinc finger-domain-containing protein  52.27 
 
 
460 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224872 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3685  hypothetical protein  41.46 
 
 
456 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738999  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0528  Zinc finger-domain-containing protein  52.27 
 
 
467 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0602  Zinc finger-domain-containing protein  52.27 
 
 
466 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0119  Zinc finger/thioredoxin putative  52.27 
 
 
466 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  33.9 
 
 
452 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0952  MJ0042 family finger-like protein  46.51 
 
 
447 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3503  hypothetical protein  47.73 
 
 
475 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1160  hypothetical protein  47.73 
 
 
446 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3506  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  47.73 
 
 
475 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3468  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  47.73 
 
 
475 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3280  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  47.73 
 
 
475 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1284  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  47.73 
 
 
475 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.743095  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0425  zinc finger/thioredoxin domain-containing protein  47.73 
 
 
475 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2504  hypothetical protein  47.73 
 
 
475 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  45.45 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  45.45 
 
 
561 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2632  Zinc finger-domain-containing protein  45.83 
 
 
575 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0860  Zinc finger-domain-containing protein  45.45 
 
 
532 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237277  normal  0.0721112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  39.13 
 
 
441 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  54.05 
 
 
421 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  48.78 
 
 
424 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3389  Zinc finger-domain-containing protein  39.66 
 
 
329 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.363159  normal  0.721643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3429  MJ0042 family finger-like protein  43.75 
 
 
466 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219707  normal  0.0286835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3636  Zinc finger-domain-containing protein  40.43 
 
 
445 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45648  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2946  MJ0042 family finger-like protein  40.43 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  43.18 
 
 
591 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  47.62 
 
 
442 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  47.62 
 
 
455 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0529  hypothetical protein  43.75 
 
 
434 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  45.24 
 
 
422 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  47.62 
 
 
451 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  47.62 
 
 
451 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  45.24 
 
 
440 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  45.24 
 
 
453 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  44.74 
 
 
421 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  44.74 
 
 
425 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1497  Zinc finger-domain-containing protein  41.86 
 
 
475 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  34.43 
 
 
359 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1102  Zinc finger/thioredoxin putative  22.68 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0261742  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  42.86 
 
 
388 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  35 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  27.27 
 
 
2179 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>