30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0977 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0977  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.489374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02997  hypothetical protein  58.09 
 
 		 356 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3653  hypothetical protein  61.29 
 
 		 199 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0364  hypothetical protein  29.93 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4403  hypothetical protein  28.39 
 
 		 440 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0609  hypothetical protein  29.25 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115481  hitchhiker  0.0000000161678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4863  hypothetical protein  26.56 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06930  hypothetical protein  25.32 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1048  hypothetical protein  27.27 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.101153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3448  MJ0042 family finger-like protein  26.78 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2868  hypothetical protein  27.87 
 
 		 591 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64170  hypothetical protein  31.87 
 
 		 425 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.87967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2624  hypothetical protein  29.92 
 
 		 372 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.776474  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4609  Zinc finger-domain-containing protein  30 
 
 		 442 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394767  normal  0.0620133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5571  hypothetical protein  30.77 
 
 		 421 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0711  Zinc finger-domain-containing protein  24.6 
 
 		 424 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4694  Zinc finger-domain-containing protein  22.83 
 
 		 451 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.725918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3034  MJ0042 family finger-like protein  30.33 
 
 		 486 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0809  hypothetical protein  24.03 
 
 		 404 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4872  Zinc finger-domain-containing protein  22.83 
 
 		 455 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0616  hypothetical protein  24.6 
 
 		 422 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4819  Zinc finger-domain-containing protein  22.83 
 
 		 451 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3209  hypothetical protein  24.28 
 
 		 375 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.737407  normal  0.0103379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0179  hypothetical protein  31.58 
 
 		 359 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2984  Zinc finger-domain-containing protein  27.68 
 
 		 452 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134771  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3447  Zinc finger-domain-containing protein  23.49 
 
 		 421 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3067  Zinc finger/thioredoxin putative  26.47 
 
 		 561 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0022  Zinc finger/thioredoxin putative  27.71 
 
 		 332 aa  45.1  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2789  hypothetical protein  28.46 
 
 		 473 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3988  Zinc finger-domain-containing protein  26 
 
 		 441 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>