174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0094 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  92.13 
 
 		 254 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  83.73 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  77.91 
 
 		 257 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  73.17 
 
 		 246 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  71.14 
 
 		 246 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  76.99 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  59.92 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  52.72 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  54.77 
 
 		 246 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  50.63 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  55.75 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  55.75 
 
 		 244 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  57.27 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  55.31 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  51.04 
 
 		 244 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  50.41 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  48.78 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  48.35 
 
 		 250 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  47.93 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  48.35 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  50.42 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  46.47 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  45.64 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  49.18 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  47.93 
 
 		 264 aa  215  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  47.62 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  48.68 
 
 		 235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  44.69 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  46.19 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  46.19 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  41.87 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  40.68 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  45.54 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  41.74 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  41.09 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  41.74 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  35.66 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  37.65 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  37.57 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  29.54 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  29.54 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  29.54 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  30.13 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  31.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  32.68 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  20.47 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  29.28 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  32.03 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  36.79 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  34.03 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  27.03 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  30.63 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  43.02 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  30.26 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  30.94 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  30.26 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  27.78 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  29.84 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  30.26 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  27.78 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 810 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  28.93 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  26.53 
 
 		 292 aa  52  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  28.05 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  27.17 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  43.28 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  32.9 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  32.26 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  39.34 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  26.83 
 
 		 245 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  27.67 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>