188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1586 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  32.68 
 
 
259 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  33.97 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  35.58 
 
 
245 aa  89  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  37.28 
 
 
241 aa  88.6  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  32.06 
 
 
238 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  37.71 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  35.86 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  35.76 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  35.97 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  35.22 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  31.8 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  31.8 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  31.8 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  27.87 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  29.29 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  27.32 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  26.64 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  30.09 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  33.96 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  31.65 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  33.82 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  39.64 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  32.02 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  32.02 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  31.46 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  31.56 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2160  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000564941  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2237  methyltransferase type 11  32.02 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000104202  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175678  decreased coverage  0.0000300845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  25.96 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  30.94 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2368  methyltransferase type 11  31.46 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  normal  0.0100279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  33.8 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2562  hypothetical protein  31.46 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  28.31 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  28.5 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  33.76 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  27.44 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  31.98 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2029  hypothetical protein  46.03 
 
 
246 aa  62.4  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60708  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  30.32 
 
 
246 aa  62  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1478  hypothetical protein  23.11 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  30.61 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1505  hypothetical protein  24.06 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  29.94 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  25.15 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1993  methyltransferase type 11  31.44 
 
 
271 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.500788  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
257 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  58.5  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  30 
 
 
273 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  27.85 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  46.03 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  32.77 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  38.1 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  36.9 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  36.9 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  36.9 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  36.9 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  26.87 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  30.92 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1990  hypothetical protein  28.66 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000251541  hitchhiker  0.00000167474 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  41.18 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  41.18 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2113  hypothetical protein  28.4 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>