110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2938 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  65.06 
 
 		 248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  64.11 
 
 		 262 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  64.11 
 
 		 262 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  63.79 
 
 		 253 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  63.31 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  59.18 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  46.26 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  43.03 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  44.44 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  44.69 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  43.81 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  43.42 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  40.33 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  42.92 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  41.82 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  40.08 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  40.08 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  39.84 
 
 		 244 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  39.09 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  38.8 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  41.26 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  40.25 
 
 		 246 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  35.48 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  41.36 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  37.45 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  38.59 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  34.02 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  34.39 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  33.19 
 
 		 256 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  29.45 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  29.58 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  31.25 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  28.41 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  28.98 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  28.41 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  28.26 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  27.01 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  26.28 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  26.28 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  26.58 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  26.58 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  29.68 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  30.08 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  27.84 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  27.84 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  27.84 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  27.08 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  29.61 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  26.34 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  29.7 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  28.99 
 
 		 241 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  30.82 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  36.56 
 
 		 233 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  26.32 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 281 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.86 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  29.03 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  24.53 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>