92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2205 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  90.84 
 
 		 262 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  90.84 
 
 		 262 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  65.57 
 
 		 253 aa  337  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  63.31 
 
 		 256 aa  323  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  58.7 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  57.66 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  44 
 
 		 252 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  41.87 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  41.57 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  42.11 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  42.02 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  44.39 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  44.14 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  44.14 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  40.32 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  42.79 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  40.39 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  43.58 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  40.93 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  37.7 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  39 
 
 		 259 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  38.31 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  39.43 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  38.17 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  42.86 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  37.4 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  41.7 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  41.48 
 
 		 235 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  36.41 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  39.89 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  34.05 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  31.39 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  30.61 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  30.57 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  31.76 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  29.72 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  31.08 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  31.03 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  28.99 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  26.06 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  28.36 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  29.01 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  26.14 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  28.41 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  28.81 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  28.38 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  28.81 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  28.81 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  27.84 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 272 aa  48.9  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  32.74 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  24.38 
 
 		 252 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  21.54 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  21.54 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  23.56 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  32.91 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  21.57 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.51 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2562  hypothetical protein  33.05 
 
 		 244 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>