188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0613 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  84.38 
 
 		 254 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  83.73 
 
 		 254 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  80.91 
 
 		 257 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  74.5 
 
 		 255 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  73.33 
 
 		 246 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  72.5 
 
 		 246 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  58.78 
 
 		 255 aa  291  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  54.69 
 
 		 246 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  50.2 
 
 		 248 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  51.63 
 
 		 257 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  53.06 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  52.65 
 
 		 250 aa  255  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  52.65 
 
 		 244 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  55.25 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  49.79 
 
 		 244 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  49.17 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  49.19 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  48.57 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  50.42 
 
 		 258 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  47.93 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  47.93 
 
 		 258 aa  225  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  44.72 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  45.9 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  48.21 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  46.91 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  46.93 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  46.51 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  43.03 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  45.23 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  41.57 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  46.58 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  46.58 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  43.86 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  41.99 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  42.66 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  43.18 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  38.79 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.12 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  35.6 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  27.66 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  32.09 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  31.33 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  28.14 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  29.47 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  28.27 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  31.69 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  30.41 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  33.11 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  28.87 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  30.73 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  29.49 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  31.91 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  29.53 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  29.53 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  26.47 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  29.53 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  28.21 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  34.91 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  28.21 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  24.17 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  28.21 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  29.05 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  28.8 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  28.77 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 252 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  50 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  28.08 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  28.38 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  30.6 
 
 		 240 aa  49.7  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>