202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1514 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  88.12 
 
 		 262 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  89.69 
 
 		 262 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  61.38 
 
 		 264 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  55.51 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  55.51 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  56.72 
 
 		 270 aa  255  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  57.14 
 
 		 270 aa  254  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  56.3 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  56.3 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  56.3 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  56.3 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  57.98 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  56.3 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  56.3 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  56.3 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  55.88 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  57.98 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  57.14 
 
 		 270 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  50 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  52.23 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  49.03 
 
 		 289 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  49.03 
 
 		 278 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  42.75 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  50.2 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  46.33 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  46.26 
 
 		 272 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  45.11 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  44.4 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  44.31 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  48.66 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  46.46 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  46.26 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  47.77 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  44.58 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  45.8 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  41.34 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  44.34 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  35.12 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  33.05 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  36.45 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  37.8 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  37.08 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  35.52 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  34.78 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  34.97 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  37.36 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  37.36 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  34.74 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  34.78 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  32.52 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 281 aa  99.8  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  35.43 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  35.43 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  35.43 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  34.52 
 
 		 248 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01982  SAM-dependent methyltransferase  28.63 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0899928  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  31.67 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  31.67 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  31.67 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  36.08 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0927  hypothetical protein  34.57 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  29.41 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  32.4 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1008  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.30893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  34.52 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.73 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  32.73 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  32.73 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  33.93 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  33.93 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  32.73 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  32.73 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  32.73 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  33.93 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  33.93 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  44.66 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3395  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0226  putative methyltransferase  45.16 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.306208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0747  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3137  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  36.76 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  36.76 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2405  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000054143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1142  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  27.96 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2206  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553658  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  32.02 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  31 
 
 		 259 aa  72  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  31 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>