More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0842 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  78.68 
 
 		 272 aa  457  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  51.05 
 
 		 264 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  46.36 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  46.36 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  46.36 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  46.36 
 
 		 270 aa  254  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  45.98 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  45.98 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  45.98 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  45.98 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  45.98 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  45.98 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  45.98 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  45.98 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  45.59 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  45.98 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  45.59 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 271 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  42.5 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  42.2 
 
 		 289 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  44.7 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  47.5 
 
 		 238 aa  221  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  44.76 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  50 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  45.3 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  45.3 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  44.89 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  46.33 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  44.84 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  44.84 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  41.91 
 
 		 273 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  46.34 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  43.57 
 
 		 245 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  42.41 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  41.1 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  40.74 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  40.81 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  36.74 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  38.46 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  30.86 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  32.14 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  28.89 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  30.32 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0927  hypothetical protein  29.86 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  29.86 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  30.31 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  31.67 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  32.73 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  30.59 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  32.55 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  32.55 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  32.55 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  32.55 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  30.14 
 
 		 253 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  32.85 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  31.6 
 
 		 240 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0747  methyltransferase type 11  31.28 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01982  SAM-dependent methyltransferase  27.49 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0899928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  28.11 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.8 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  29.8 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  29.8 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  29.8 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  34.48 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  34.48 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  36.73 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  30.52 
 
 		 245 aa  89  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  28.12 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3395  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  29.8 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0226  putative methyltransferase  29.41 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.306208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  29.8 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  29.02 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1008  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.30893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1142  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  30.73 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 239 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3137  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  28.38 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  28.38 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  28.38 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  32.49 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175678  decreased coverage  0.0000300845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2206  methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2405  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000054143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>