240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4896 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  100 
 
 		 245 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  53.44 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  59.4 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  52.08 
 
 		 278 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  53.1 
 
 		 233 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  56.28 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  56.28 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  53.88 
 
 		 273 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  53.39 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2528  hypothetical protein  48.5 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  45.61 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  40.84 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  42.74 
 
 		 270 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  49.79 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  41.42 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  45.5 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  39.69 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  45.02 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  45.02 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  41.99 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  41.99 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  41.99 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  46.79 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  41.99 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  41.99 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  41.99 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  41.99 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  41.99 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  43.66 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  40.62 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  40.83 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  39.57 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  37.5 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  39.17 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  39.71 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  40.71 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  36.24 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  40.51 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  36.15 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  37.06 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  36.63 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  31.71 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  38.85 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0927  hypothetical protein  28.69 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  34.92 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  30.81 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  36.42 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  37.58 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  35.95 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  33.89 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  35.95 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  30.62 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  36.42 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  30 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  30.62 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  37.71 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  37.25 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  35.57 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  35.26 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  35.48 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  29.28 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01982  SAM-dependent methyltransferase  31.65 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0899928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1008  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.30893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  29.3 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  38.68 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  34.01 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  29.94 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  34.01 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  34.01 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  34.01 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  38.68 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  34.01 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  32.68 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 244 aa  72  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  33.78 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  33.78 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0747  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0226  putative methyltransferase  41.41 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.306208  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.11 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3395  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  33.11 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3137  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  33.11 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1142  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175678  decreased coverage  0.0000300845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  29.59 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2206  methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>