180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2018 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  100 
 
 
255 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  59.22 
 
 
255 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  59.92 
 
 
254 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  58.65 
 
 
246 aa  291  5e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  58.78 
 
 
259 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  55.86 
 
 
257 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  59.49 
 
 
246 aa  290  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  58.33 
 
 
254 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  54.39 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  59.73 
 
 
244 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  59.73 
 
 
250 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  58.85 
 
 
250 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  55.51 
 
 
246 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  54.32 
 
 
257 aa  258  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  57.59 
 
 
244 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  57.27 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  50.41 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  49.79 
 
 
253 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  50.42 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  49.55 
 
 
264 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  49.79 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  50.89 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  49.79 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  48.95 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  47.68 
 
 
259 aa  208  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  47.76 
 
 
259 aa  208  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  47.88 
 
 
255 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  48.82 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  42.91 
 
 
262 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  42.91 
 
 
262 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  39.92 
 
 
244 aa  174  9e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  40.93 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  42.8 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  40.47 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  38.6 
 
 
256 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  40.71 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  39.82 
 
 
248 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  39.92 
 
 
256 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  38.43 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.13 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  31.38 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  30.46 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  31.66 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  31.33 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  31.14 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  30.91 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  30.91 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  31.25 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  30.91 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  30.91 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  30.91 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  30.91 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  30.91 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  29.76 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  36.9 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  31.93 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  31.45 
 
 
289 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  29.47 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.67 
 
 
230 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  29.94 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
270 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.83 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
260 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
264 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
265 aa  52  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  28.96 
 
 
287 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  28.96 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.36 
 
 
282 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  40 
 
 
196 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  36.9 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
244 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
284 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  44.64 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
222 aa  49.7  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
271 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  30.65 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  35 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  29.53 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
634 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  33.58 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5480  methyltransferase type 12  36.67 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  29.57 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0260  methyltransferase type 11  37.33 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.77 
 
 
269 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
262 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
238 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>