More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1252 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1252  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000946756  hitchhiker  0.00866673 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1189  adenine phosphoribosyltransferase  71.1 
 
 
189 aa  258  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1201  adenine phosphoribosyltransferase  68.82 
 
 
189 aa  245  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  0.998677 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0544  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0108  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
182 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 
173 aa  121  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  41.57 
 
 
179 aa  121  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
174 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
174 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
174 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
176 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  50.34 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
185 aa  119  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0881  adenine phosphoribosyltransferase  49.33 
 
 
172 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
172 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14411  adenine phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 
174 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  47.86 
 
 
190 aa  115  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
170 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
180 aa  114  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2307  Adenine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0679858  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
179 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  48.98 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
173 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  44 
 
 
171 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
170 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1169  adenine phosphoribosyltransferase  40.33 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0215372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
168 aa  111  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  43.05 
 
 
170 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  43.05 
 
 
171 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  40.68 
 
 
181 aa  111  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  50.39 
 
 
171 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09083  adenine phosphoribosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_7G02310)  38.22 
 
 
214 aa  110  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000528084  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
172 aa  111  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  44.07 
 
 
214 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  42.95 
 
 
177 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  44 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  42.38 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0834  putative adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 
177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14741  adenine phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0518305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
180 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
173 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
182 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
177 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  44 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  42.57 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 
171 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  43.14 
 
 
184 aa  108  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
198 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
187 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
188 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
176 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
171 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  42.48 
 
 
181 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 
172 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
183 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 
192 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
180 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  42.67 
 
 
173 aa  106  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  42.11 
 
 
184 aa  106  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
172 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
172 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
172 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
181 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
181 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
172 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
188 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17570  adenine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
177 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
173 aa  105  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
181 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
181 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1608  adenine phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
182 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000613575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
187 aa  105  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0840  adenine phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
185 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0968  Adenine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
172 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
183 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
183 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1044  adenine phosphoribosyltransferase  36.87 
 
 
182 aa  105  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>