More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1189 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1189  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
189 aa  383  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1201  adenine phosphoribosyltransferase  93.65 
 
 
189 aa  346  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0724854  normal  0.998677 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1252  adenine phosphoribosyltransferase  67.74 
 
 
190 aa  241  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000946756  hitchhiker  0.00866673 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0544  adenine phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0108  adenine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
172 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
180 aa  121  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
171 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  39.66 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
214 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
178 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
171 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09083  adenine phosphoribosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_7G02310)  35.85 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000528084  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0834  putative adenine phosphoribosyltransferase  38.38 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 
171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 
170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
173 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
173 aa  112  3e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0881  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 
179 aa  111  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  39.75 
 
 
171 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
172 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
181 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  43.71 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  38.18 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0968  Adenine phosphoribosyltransferase  46.31 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  37.21 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  38.18 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 
173 aa  109  3e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14411  adenine phosphoribosyltransferase  38.89 
 
 
172 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
179 aa  109  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
174 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  42.48 
 
 
175 aa  109  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  39.51 
 
 
172 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17570  adenine phosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  40.26 
 
 
193 aa  108  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
171 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
190 aa  107  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  43.42 
 
 
177 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 
205 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 
180 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
172 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
183 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 
182 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2616  adenine phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 
182 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.996002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
187 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
186 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  40.79 
 
 
187 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
175 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
170 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  40.52 
 
 
170 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
181 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  35.39 
 
 
181 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1608  adenine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
182 aa  106  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000613575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
231 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  36.75 
 
 
179 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 
179 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 
181 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 
174 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
177 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  40.4 
 
 
190 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  40.13 
 
 
177 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
184 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
172 aa  104  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 
186 aa  104  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 
170 aa  104  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  41.83 
 
 
177 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 
179 aa  104  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
184 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
181 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>