141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1483 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1483  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.193317  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0333  N-acetylneuraminic acid synthase, N-terminal domain  56.08 
 
 
363 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.331281  normal  0.664973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  36.99 
 
 
497 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1340  N-acetylneuraminate synthase  28.13 
 
 
521 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00426215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  30.19 
 
 
348 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.52 
 
 
344 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  29.02 
 
 
348 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.62 
 
 
356 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  24.25 
 
 
344 aa  97.4  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  28.08 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  30.23 
 
 
350 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  24.13 
 
 
351 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  26.03 
 
 
347 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0440  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.56 
 
 
342 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  25.49 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0364  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  24.33 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.431709  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  27.71 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.92 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  27.38 
 
 
364 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  24.68 
 
 
749 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  28.34 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1894  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.15 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  25.72 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  30.89 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  26.42 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.48 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  25.96 
 
 
348 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  26.9 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  24.21 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  28.81 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2635  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.38 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.01 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.68 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  34.81 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  30.93 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  28.2 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.86 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2713  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.39 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.314547  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1574  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.39 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000030231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  23.23 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14241  sialic acid synthase  27.24 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.532641  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  30.6 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1187  N-acetylneuraminate synthase  28.07 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  28.16 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  28.23 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  27.78 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  28.81 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  24.35 
 
 
761 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  40.37 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  29.83 
 
 
345 aa  77  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  28.57 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  37.93 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  23.68 
 
 
748 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  25.21 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  26.81 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.1 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  28.38 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1140  polysaccharide biosynthesis protein, putative sialic acid synthase  26.21 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  25.11 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.14 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1890  N-acetylneuraminate synthase  32.35 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000120962  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  22.95 
 
 
762 aa  73.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.147767  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0960  neuB family protein  27.31 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.22 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.15 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  27.54 
 
 
343 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0455  N-acetylneuraminate synthase  26.59 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  29.93 
 
 
343 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  27.03 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  22.8 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.6 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  23.05 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  23.38 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.29 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  22.6 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  27.44 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.73 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.71 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  26.98 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.49 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  29.47 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2841  N-acetylneuraminate synthase  37.3 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893161  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1405  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  26.21 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2958  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  26.21 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  27.1 
 
 
358 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  22.8 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  23.53 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  24.84 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.24 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3261  polysaccharide biosynthesis related-protein  25.1 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.11 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1912  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.11 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000713145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3363  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  22.34 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0423  N-acetylneuraminate synthase  25.93 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  27.62 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1346  N-acetylneuraminate synthase  25.27 
 
 
289 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.107531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  25 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  29.25 
 
 
342 aa  65.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  30.6 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>