56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0766 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0766  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0738  hypothetical protein  93.78 
 
 		 232 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0779  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  76.08 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0946861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4451  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  65.55 
 
 		 232 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4738  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.9226  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 250 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2737  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.65 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0959  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1119  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.74 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 		 240 aa  64.7  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.41 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 266 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.857449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.48 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  25.86 
 
 		 282 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 283 aa  51.6  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.3 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.86 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.576341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2130  3-hydroxy acid dehydrogenase  26.55 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  23.12 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.49 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 266 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  0.0943454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.36 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1490  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.88 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  22.16 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22 
 
 		 238 aa  44.7  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371699  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.91 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.47 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.31 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 		 270 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.96 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.91 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  22.84 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.42 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.42 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  24.14 
 
 		 274 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  25.71 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  27.56 
 
 		 261 aa  42  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.21 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  24.61 
 
 		 303 aa  41.6  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.57 
 
 		 253 aa  41.6  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.21 
 
 		 276 aa  41.6  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 254 aa  41.2  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>