23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2762 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1003    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  63.86 
 
 		 491 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  54.31 
 
 		 508 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  56 
 
 		 282 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  76.73 
 
 		 391 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  48.22 
 
 		 444 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  36.65 
 
 		 300 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  33.11 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  30.56 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  32.43 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  29.06 
 
 		 366 aa  103  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  31.56 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  29.7 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  33.45 
 
 		 446 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  40.57 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3706  hypothetical protein  35.14 
 
 		 623 aa  60.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0018  type III effector HopO1-1  35.42 
 
 		 283 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1647  hypothetical protein  35 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.359391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0881  hypothetical protein  31.93 
 
 		 258 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4594  type III effector HopO1-2  32.17 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0882  hypothetical protein  27.11 
 
 		 251 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02068  hypothetical protein  29.81 
 
 		 259 aa  43.5  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2279  hypothetical protein  26.32 
 
 		 752 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>