16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0805 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  915    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  80.36 
 
 
448 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  68.01 
 
 
446 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  62.95 
 
 
448 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  48.8 
 
 
455 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  56.38 
 
 
300 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  94.81 
 
 
161 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  52.46 
 
 
366 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  52.36 
 
 
447 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  94.29 
 
 
111 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  30.8 
 
 
508 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  31.21 
 
 
491 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2338  hypothetical protein  35.6 
 
 
669 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.498046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  31.16 
 
 
282 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  33.98 
 
 
495 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  33.91 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>