15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1165 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  747    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  93.33 
 
 		 447 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  53.61 
 
 		 446 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  52.04 
 
 		 300 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  51.02 
 
 		 448 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  52.46 
 
 		 445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  48.64 
 
 		 448 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  46.2 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  47.71 
 
 		 161 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  29.45 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  50.48 
 
 		 111 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  33.03 
 
 		 508 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  32.68 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  29.06 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  27.8 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>