17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3551 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  73.66 
 
 
448 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  907    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  68.3 
 
 
448 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  68.01 
 
 
445 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  52.63 
 
 
455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  59.4 
 
 
300 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  53.61 
 
 
366 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  52.05 
 
 
447 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  77.27 
 
 
161 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  31.34 
 
 
508 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  72.38 
 
 
111 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  31.69 
 
 
491 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2338  hypothetical protein  38.02 
 
 
669 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.498046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  33.45 
 
 
495 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  37.33 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  32.87 
 
 
282 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0235  hypothetical protein  34.4 
 
 
704 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0280045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>