15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5201 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  59.4 
 
 		 446 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  57.81 
 
 		 448 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  56.71 
 
 		 445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  53.69 
 
 		 448 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  52.04 
 
 		 366 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  54.31 
 
 		 447 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  49.67 
 
 		 455 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  57.79 
 
 		 161 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  35.42 
 
 		 491 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  35.56 
 
 		 495 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  28.99 
 
 		 508 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  52.83 
 
 		 111 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  31.65 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  40.61 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>