16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3793 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  919    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  69.2 
 
 		 448 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  68.3 
 
 		 446 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  62.95 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  53.06 
 
 		 455 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  53.16 
 
 		 300 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  48.64 
 
 		 366 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  47.96 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  68.18 
 
 		 161 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  28.75 
 
 		 508 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  64.76 
 
 		 111 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  29.9 
 
 		 491 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2338  hypothetical protein  40.21 
 
 		 669 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.498046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  31.56 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  31.82 
 
 		 282 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  32.57 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>