17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0686 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  52.63 
 
 		 446 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  53.06 
 
 		 448 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  52.62 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  48.8 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  49.35 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  46.2 
 
 		 366 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  49.1 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  29.59 
 
 		 508 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  34.94 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2338  hypothetical protein  39.49 
 
 		 669 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.498046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  43.75 
 
 		 161 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  30.56 
 
 		 495 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  36.36 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  26.43 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  33.96 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0235  hypothetical protein  32.71 
 
 		 704 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0280045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>