16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2457 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1035    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  54.91 
 
 		 491 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  56.93 
 
 		 282 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  54.31 
 
 		 495 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  64.94 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  30.8 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  29.85 
 
 		 448 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  31.34 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  28.77 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  28.66 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  31.56 
 
 		 300 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  33.03 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  30.56 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2338  hypothetical protein  30.97 
 
 		 669 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.498046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>