14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3103 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  794    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  74.73 
 
 		 491 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  66.49 
 
 		 495 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  48.32 
 
 		 508 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  66.18 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4019  hypothetical protein  44.58 
 
 		 416 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  38.04 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  35.14 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  33.7 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  33.87 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  34.68 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  32.68 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  31.37 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  32.34 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>