18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4019 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4019  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  866    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2800  hypothetical protein  53.24 
 
 		 358 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0047  hypothetical protein  52.88 
 
 		 358 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2725  HNH endonuclease domain-containing protein  59.91 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.881817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1481  HNH endonuclease domain-containing protein  59.91 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0309  HNH endonuclease domain-containing protein  54.44 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.201927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  53.93 
 
 		 484 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0137  hypothetical protein  97.4 
 
 		 77 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4108  hypothetical protein  97.4 
 
 		 77 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.988398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  44.58 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0316  hypothetical protein  46.22 
 
 		 210 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.17511  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  61.02 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  61.02 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  61.02 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  61.02 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  61.02 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  61.02 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3575  hypothetical protein  77.78 
 
 		 37 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.001232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>