22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1481 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1481  HNH endonuclease domain-containing protein  100 
 
 
382 aa  790    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2725  HNH endonuclease domain-containing protein  100 
 
 
382 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.881817  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2800  hypothetical protein  83.27 
 
 
358 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0047  hypothetical protein  82.18 
 
 
358 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0309  HNH endonuclease domain-containing protein  67.95 
 
 
460 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.201927  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  96.62 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4019  hypothetical protein  59.91 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.33 
 
 
392 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  46.33 
 
 
399 aa  179  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  46.33 
 
 
392 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  46.33 
 
 
392 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  46.33 
 
 
392 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  35.78 
 
 
392 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0549  HNH endonuclease domain-containing protein  55.63 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.663462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0610  HNH endonuclease  55.63 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4359  putative cytoplasmic protein  39.44 
 
 
546 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000209725  hitchhiker  2.2627499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0137  hypothetical protein  59.49 
 
 
77 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4108  hypothetical protein  59.49 
 
 
77 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.988398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0461  HNH endonuclease  38.84 
 
 
145 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000201812  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0316  hypothetical protein  71.43 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.17511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3575  hypothetical protein  75 
 
 
37 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.001232  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5348  hypothetical protein  38.36 
 
 
262 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>