21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0309 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0309  HNH endonuclease domain-containing protein  100 
 
 
460 aa  957    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.201927  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0549  HNH endonuclease domain-containing protein  77.34 
 
 
392 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.663462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0610  HNH endonuclease  77.34 
 
 
392 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2725  HNH endonuclease domain-containing protein  67.95 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.881817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1481  HNH endonuclease domain-containing protein  67.95 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2800  hypothetical protein  83.33 
 
 
358 aa  319  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0047  hypothetical protein  83.33 
 
 
358 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0623  hypothetical protein  93.42 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4019  hypothetical protein  54.44 
 
 
416 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4359  putative cytoplasmic protein  41.96 
 
 
546 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000209725  hitchhiker  2.2627499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  43.26 
 
 
392 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  43.26 
 
 
392 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  43.26 
 
 
399 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  43.26 
 
 
392 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  43.26 
 
 
392 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  43.26 
 
 
392 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0137  hypothetical protein  59.49 
 
 
77 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4108  hypothetical protein  59.49 
 
 
77 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.988398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0461  HNH endonuclease  41.46 
 
 
145 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000201812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3575  hypothetical protein  75 
 
 
37 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.001232  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5348  hypothetical protein  34.15 
 
 
262 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>