15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0549 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0549  HNH endonuclease domain-containing protein  100 
 
 		 392 aa  817    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.663462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0610  HNH endonuclease  99.49 
 
 		 392 aa  812    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0309  HNH endonuclease domain-containing protein  77.34 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.201927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2725  HNH endonuclease domain-containing protein  55.63 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.881817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1481  HNH endonuclease domain-containing protein  55.63 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4359  putative cytoplasmic protein  40.85 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000209725  hitchhiker  2.2627499999999997e-21 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  39.01 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.01 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  39.01 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  39.01 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  39.01 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  39.01 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0461  HNH endonuclease  43.9 
 
 		 145 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000201812  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5348  hypothetical protein  39.73 
 
 		 262 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109769 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0921  hypothetical protein  33.87 
 
 		 336 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>