15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0316 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0316  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  430  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.17511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3640  hypothetical protein  63.1 
 
 		 87 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4019  hypothetical protein  46.22 
 
 		 416 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3921  HNH endonuclease domain-containing protein  46.51 
 
 		 392 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03293  hypothetical protein  46.51 
 
 		 392 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0067205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0273  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.51 
 
 		 392 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3883  HNH endonuclease domain protein  46.51 
 
 		 399 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03246  hypothetical protein  46.51 
 
 		 392 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00723229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  40.54 
 
 		 1409 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3641  HNH endonuclease domain-containing protein  46.51 
 
 		 392 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0682623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2800  hypothetical protein  52.13 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2725  HNH endonuclease domain-containing protein  52.56 
 
 		 382 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.881817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1481  HNH endonuclease domain-containing protein  52.56 
 
 		 382 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0438978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0047  hypothetical protein  51.61 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0845  hypothetical protein  60.47 
 
 		 46 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>