15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3731 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  93.33 
 
 
366 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  100 
 
 
447 aa  911    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  52.05 
 
 
446 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  52.13 
 
 
300 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  50 
 
 
448 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  52.36 
 
 
445 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  47.96 
 
 
448 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  49.1 
 
 
455 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  48.37 
 
 
161 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  29.09 
 
 
491 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  49.04 
 
 
111 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  30.56 
 
 
508 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  29.7 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  26.88 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  31.37 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>