11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0781 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  92.73 
 
 		 161 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  93.88 
 
 		 445 aa  193  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  91.84 
 
 		 448 aa  190  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  72.45 
 
 		 446 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  63.73 
 
 		 448 aa  139  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  52.04 
 
 		 300 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  43.9 
 
 		 366 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  48.96 
 
 		 447 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  33.01 
 
 		 455 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  30 
 
 		 508 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>