17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1637 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  80.36 
 
 
445 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  922    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  73.66 
 
 
446 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  69.2 
 
 
448 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  52.62 
 
 
455 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  57.48 
 
 
300 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  95.45 
 
 
161 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  51.02 
 
 
366 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  50 
 
 
447 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0781  hypothetical protein  92.38 
 
 
111 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  29.85 
 
 
508 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2338  hypothetical protein  40.21 
 
 
669 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.498046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  32.3 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  34.75 
 
 
495 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  31.16 
 
 
282 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  34.97 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0235  hypothetical protein  38.26 
 
 
704 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0280045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>