14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5630 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  57.4 
 
 		 491 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  56.93 
 
 		 508 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  56 
 
 		 495 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  66.21 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  31.65 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  32.09 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  31.82 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  31.16 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  26.88 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  27.8 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  32.41 
 
 		 446 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  28.31 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>