22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1074 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  995    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  63.86 
 
 		 495 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5630  hypothetical protein  57.4 
 
 		 282 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2457  hypothetical protein  54.91 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.362159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3103  hypothetical protein  70 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  50.51 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5201  hypothetical protein  36.65 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0686  hypothetical protein  34.94 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3731  hypothetical protein  29.09 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1165  hypothetical protein  29.45 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45098  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1637  hypothetical protein  32.3 
 
 		 448 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0805  hypothetical protein  31.21 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.0747184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3793  hypothetical protein  29.9 
 
 		 448 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0444621  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3551  hypothetical protein  31.69 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00802896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4226  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1647  hypothetical protein  32.41 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.359391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3706  hypothetical protein  31.21 
 
 		 623 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02067  hypothetical protein  31.25 
 
 		 249 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0018  type III effector HopO1-1  24.14 
 
 		 283 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2279  hypothetical protein  26.19 
 
 		 752 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313437  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0882  hypothetical protein  30.06 
 
 		 251 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00560  exoenzyme T  30.52 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507826  normal  0.0561586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>