16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3706 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3706  hypothetical protein  100 
 
 
623 aa  1269    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6237  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  49.85 
 
 
335 aa  324  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7009  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  48.96 
 
 
335 aa  317  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1223  hypothetical protein  45.35 
 
 
349 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3544  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  45.65 
 
 
335 aa  269  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1887  hypothetical protein  41.42 
 
 
345 aa  264  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2421  hypothetical protein  40.24 
 
 
350 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4090  hypothetical protein  27.38 
 
 
353 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  32.05 
 
 
495 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4594  type III effector HopO1-2  28.75 
 
 
298 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976788  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0018  type III effector HopO1-1  28.86 
 
 
283 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  30.2 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  31.21 
 
 
491 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3890  hypothetical protein  38.24 
 
 
320 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0607  Phage Mu protein F like protein  28.83 
 
 
510 aa  45.4  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125441  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0669  Phage Mu protein F like protein  28.83 
 
 
510 aa  45.4  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000892912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>