17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3544 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3544  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  100 
 
 
335 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6237  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  49.09 
 
 
335 aa  328  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7009  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  49.09 
 
 
335 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3706  hypothetical protein  45.65 
 
 
623 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1223  hypothetical protein  45.22 
 
 
349 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1887  hypothetical protein  43.58 
 
 
345 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2421  hypothetical protein  37.65 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4090  hypothetical protein  28.45 
 
 
353 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0836  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  38.95 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3890  hypothetical protein  37.89 
 
 
320 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4258  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  32.73 
 
 
315 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0353  SPP1 family phage head morphogenesis protein  30.94 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0344  SPP1 family phage head morphogenesis protein  30.94 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2698  hypothetical protein  28.3 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1199  hypothetical protein  43.55 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2897  hypothetical protein  39.34 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4107  hypothetical protein  34.78 
 
 
308 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134248  hitchhiker  0.00000215807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>