15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1887 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1887  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  698    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1223  hypothetical protein  59.71 
 
 		 349 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2421  hypothetical protein  48.51 
 
 		 350 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7009  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  44.48 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6237  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  43.58 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3706  hypothetical protein  41.42 
 
 		 623 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3544  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  43.58 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4090  hypothetical protein  26.96 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000824398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0836  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  33.33 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4258  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  42.11 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0344  SPP1 family phage head morphogenesis protein  32.03 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0353  SPP1 family phage head morphogenesis protein  32.03 
 
 		 320 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1199  hypothetical protein  41.94 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3890  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2897  hypothetical protein  34.43 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>