15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1223 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1223  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1887  hypothetical protein  59.71 
 
 
345 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3706  hypothetical protein  45.35 
 
 
623 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7009  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  47.01 
 
 
335 aa  295  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6237  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  46.11 
 
 
335 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2421  hypothetical protein  47.98 
 
 
350 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3544  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  44.61 
 
 
335 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4090  hypothetical protein  28.09 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000824398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0836  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  27.03 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1199  hypothetical protein  43.24 
 
 
290 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3890  hypothetical protein  34.74 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4258  putative head morphogenesis protein SPP1 gp7  29.92 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2897  hypothetical protein  29.2 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4107  hypothetical protein  28.32 
 
 
308 aa  46.2  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134248  hitchhiker  0.00000215807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2698  hypothetical protein  31.78 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>